mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTCTA GGGCTCCTTATAGTTCAAAC TAGGGCTCCTTATAGTTCAAACGAGAGTTCAGCAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGAATCCCATAAGCCCTAATCCTTATTTATAAAAAGGATTTGGTTATATGGCTTACATATCTCAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA 1 0 3' arm Brassica_napus micropc MIR159 9e-62 bra-MIR159a 1e-94 -72.5 (((((((((((.(((((((((.((((((..((((((((((...((((((.((.((.((((.(..(((((((((..(((((((.........))))))).)))).)))))..).)))).)).)).))))))...))))))......))))...)))))).))))))))).))))))))))) (-72.50)