mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTCT AGCTCCTTGAAGTCCAATA GGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAAGCTCCTGCTGGGTAGATCGAGCTGCTGAGCTATGAATCCCACAGCCCTATCACCATCAGTCATTTTGATGGGCCTGCGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTATTACCTAATGTTAGATCTTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCT 2 0 3' arm Populus_nigra micropc MIR159 9e-77 ptc-MIR159b 1e-78 -73.32 ((((((((((..(((((((.(((((.((..(((((((((...(((((.(((((.((((....((.(((.(((((((.............))))))).))).))....)))).))))).)))))..)))))))..))..)).))))).)))))))..)))))))))) (-73.32)