mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCAAAGGAGATTTGCCC GCAACTCTCCTTAAGCAAA GGGCAACTCTCCTTAAGCAAAAATGGATGTGCTTTTCTTTGCATAATTCGATTTTGCCAAAGGAGATTTGCCC 3 0 3' arm Gossypium_hirsutum micropc mir-399 0.00000002 ghr-MIR399d 5e-36 -34.9 ((((((.(((((((..((((((.(((((((((........)))).))))).))))))..))))))).)))))) (-34.90)