mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGAGCCGTGCCAATATC TATTGGTGCGGTTCAATAAGA GATATTGGTGCGGTTCAATAAGAAAACGGTGCTCAATACTTTTTGAGCTCCGCTTTTTGATTGAGCCGTGCCAATATC 3 0 3' arm Citrus_reticulata micropc MIR171_1 3e-16 crt-MIR171 5e-39 -45.9 ((((((((..(((((((((.(((((.(((.((((((......)))))).))).))))).)))))))))..)))))))) (-45.90)