mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTCT GGCTCCTTATAGTTCAAAC AGGGCTCCTTATAGTTCAAACGAGAGTTTAGCGGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATACCATAAGCCCTAATCCTTGTATTGAAAAAGGACTTGGTAATATGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTAACTTACCCTTTAATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCT 1 0 3' arm Raphanus_raphanistrum_subsp__raphanistrum micropc MIR159 8e-59 bra-MIR159a 2e-74 -70.1 ((((((((((.(((((((((.((((((..((((((((((...((((((.((.((.((((.(..(((((...((...(((((.........)))))...))...)))))..).)))).)).)).))))))...)))))))......)))...)))))).))))))))).)))))))))) (-70.10)