mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTG GTTCAATAAAGCTGTGGGATG GATATGGTCCTCTTCGTCTTATTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCTGGCTTTATCACTCCATGAATATGATTCTTGCAAGACTTCGGTGGAGGTGACGCGATGATGGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGATGATACTAATAGGATCAACA CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTGTGATATACTGGTACTACTAGTGTCTTTACAGTAAAACACTCGTCTCTTTTGTCATACAAAAAAAACCCTTTTAGGGTTAGATCCGATATTGCGTGCTTAGAGCCAGTTAGATATGGTCCTCTTCGTCTTATTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCTGGCTTTATCACTCCATGAATATGATTCTTGCAAGACTTCGGTGGAGGTGACGCGATGATGGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGATGATACTAATAGGATCAACAAACTTCTCGCTCCGATTTTTTGGCTTTAGTTTTTAACTGCATGATATCTCAGGTTTTGTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTTTTCGGGCTTTCCCCTTCGGGTTCACAACAATAGTCACCGGCTTCTATAGTCTGGCCCGGAACCTGTAGATGCAGGTTTTGGATACTACAATATATATGTAGATGTCCTATGTTGCACAACCACAGAATTATTAGATTCTCAGCCTTTGACTTTTCCATCCGGCGAGGGAATGTTTTGTTTTTGTATGAAGCTAAATAGTTTCTCCCGTTATCAGTTATGTTCATCTGCAGCTTTTACCCCTCGAGACTAGCAGACTCGTGATCAGATCGTTTGATGTTCTGC 1 0 5' arm Coffea_canephora mirnest MIR396 0.000002 csi-MIR396b 0.000000008 -56.9 ....(((((((.((.((.(((((((((((((((.((((((((((((..((.((((..((((((.....(((...((....))..))))))))))))).))...))).))))))))).))))))))))))))).)).)).)))))))... (-56.9)