mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTATGAGGAGCCATGCATA GTATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATATGCTGAGCCCATCGAGTATCGATGACCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCATGCATAT 3 0 5' arm Arabidopsis_thaliana pmrd mir-160 7e-42 ath-MIR160a 4e-43 -47.5 ((((((.(((((((..(((((((((.(((.(((..(((((.....)))))..))).))).)))))))))..))))))).)))))) (-47.50)