mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGACTGTTGTCTGGCTCGAGG TTGAGGGGACTGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTTATTCTAATACAATCTCATTTGAATACATTCAGATCTGATGATTGATTAGGGTTTTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAA 5 0 3' arm Arabidopsis_thaliana pmrd mir-166 1e-62 ath-MIR166b 8e-64 -52.4 .((.(((((.((..((((((..(((.(((.((.((((((((.((((((((((((((....))))))..))).)))))))))))))...)).))).)))..))))))..)).))))).)). (-52.40)