mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACCAACCTTTCATCGTTCCC GAACGCATGAGAGGTTGGTAAA CTCACTCATGTGAGCAGAAAGAGTAGCATGATATTTTCTTCAAGGTCTTTACCAACCTTTCATCGTTCCCTTCTTTGCAATAACGCTGTTTTGCAAAACCGTGATAGTGCTGAGCCGATGAGCCTCTAATGAAATTATAGACTCATCGGCTCAGGACCATTGCGGTTGTGCAAAACGGTGTTATTGCTGAGAAGGGAACGCATGAGAGGTTGGTAAAGACCTCAATGGAATCTTATGGTACTCTTTTTGCTCACATGAGTGAGT 0 1 5' arm Arabidopsis_thaliana pmrd 100 ath-MIR839 2e-149 -182.8 (((((((((((((((((((((((((.(((((...((((....(((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((..((.((.(((((((((((((.((.((((...)))).)).))))))))))))).)).))..))))).))))))))))))))))))).)))))))))))).)))))))))))))))))))))....))))..))))).))))))))))))))))))))))))). (-182.80)