mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACATCTTTCTTGAACTG GTTCAATAAAGCTGTGGGATG GATATGGTCCTCTTCGTCTTATTCCACATCTTTCTTGAACTGCATCTGGCTTTATCACTCCATGAATATGATTCTTGCGAGACTTCGGAGGAGGTGACGCGATGATGGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGATGATACTAATAGGATCAACA CTCGTGTGATATACTGGTACTACTAGTGTCTTTACAGTAAAACACTCGTCTCTTTTGTCATACAAAAAAAACCCTTTTAGGGTTAGATCCGATATTGCGTGCTTAGAGCCAGTTAGATATGGTCCTCTTCGTCTTATTCCACATCTTTCTTGAACTGCATCTGGCTTTATCACTCCATGAATATGATTCTTGCGAGACTTCGGAGGAGGTGACGCGATGATGGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGATGATACTAATAGGATCAACAAACTTCTCGCTCCGATTTTTTGGCTTTAGTTTTTAACTGCATGATATCTCAGGTTTTGTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTTTTCGGGCTTTCCCCTTTTTGTGCACAACAATATTCACCGGCGTCTATAGTCTGGCCCGGAACCTGTAAATGCAGGTTTTGGATACTACAATATATATGTAGATGTCCTATGTTGAATAACCACAAAATTATTAAATTCTCGCCCTTTGACTTTTCCCTCCCGCGAGGGAATGTTTTGTTTTTGTATGAAGCTAAATGTTTTCCCCCGTTATCAGTTATGTTCATCTGCAGCTTTTCCCCCTCAAAACTACCAAACTCGTGATCAAATCTTTTGATGTTCTGCAAATAAGATGAGGTAGCTTGTATTTTATGTTTAATTCAAAAGCTGCTGCTCTTTATTTTATTTTTTCTT 2 0 5' arm Coffea_canephora mirnest MIR396 0.00003 gma-MIR396a 0.0000005 -50.9 ....(((((((.((.((.((((((((((.((((.((((((((((((..((.(((((.((((.........................))))..))))).))...))).))))))))).)))).)))))))))).)).)).)))))))... (-50.9)