mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTCGACCTGGGGGTCGAGTGGT ACTCGACTTCCAGGTTGAGTGAT TCAAGGAGATACTCGACTTCCAGGTTGAGTGATGAGGTCGAGTAGTGGTCTGGTAATGAAAGTGAAGACACTCGACTTCGGGGTCGAGTGATGTGATCGAGTGATGGTCAGGTGATGGAGATGAAGATGCTCGACCTCGTGGTCGAGTGGTGAGGTGAAGTTGTGATGTCTTCTACTCGACCTGGGGGTCGAGTGGTCTCTTGA 1 1 3' arm Arabidopsis_thaliana pmrd MIR854 0.000000003 100 -93.3 ...(((((((((((((((((((((((((((((.((.((((.....(..(((....((....)).....(((((((((.((((((((((((...(.(((..((.((......)).))...))).)...)))))))))))).)))))))))...)))..).....)))).)).)).)))))))))))))))))))).))))))).. (-93.30)