mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGAACCACACTTGGAGTCCTC GGACTCCAAGTGTGGTTATAT AAACATGTGGGAGGACTCCAAGTGTGGTTATATCCTCGGTATTATCTCGATGTGAACCACACTTGGAGTCCTCCCACATGTTT 0 1 3' arm Arabidopsis_thaliana pmrd 100 100 -58.3 ((((((((((((((((((((((((((((((((((...((......)).)))))).)))))))))))))))))))))))))))) (-58.30)