mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTACTCGACCAGGGGGTCGAGTGGTT CTACTCGACCAAGGGGTCGAGTGGTCT GATGAAGTCTTCTACTCGACCAAGGGGTCGAGTGGTCTGTTGAGGTCGTGAAGCTTCTACTCGACCAGGGGGTCGAGTGGTTTGACATGATC 7 0 3' arm Arabidopsis_thaliana pmrd MIR854 0.000005 100 -43.7 (((.(.(((..((((((((((....((((((((((...(((..........)))..))))))))))....))))))))))...))).).))) (-43.70)