mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGCCTTGCATCAACTGAATC TTCGCTTGGTGCAGGTCGGG TCGGGCTCGGATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCAATTCGGCTGACACAGCCTCGTGACTTTTAAACCTTTATTGGTTTGTGAGCAGGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGATCCTCGA 2 0 3' arm Arabidopsis_thaliana pmrd MIR168 6e-68 ath-MIR168a 3e-69 -63.2 (((((.((.((((((.((((((((((.(((((.((((((((((((...)))))...((.(((.((((((......)))))).))))).))))))).))))).)))))))))).)))))).)).)).))) (-63.20)