mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGTGCTCACTCTCTATCCG GAAGAGAGTGAGCACACAT GGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATATTTGAAGGTTCCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTCACTCTCTATCCGTCACC 1 1 3' arm Arabidopsis_thaliana pmrd mir-156 1e-43 ath-MIR156f 2e-48 -51.22 ((((((.((((((((((((((((((((((....(((..((((.............))))..))))))))))))))))))))))).)).)))))) (-51.22)