mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAAGGACCTGAAGCTATGCT CATAGCTCCATATCCTTCAATG TGACACGGAAGCATAGCTCCATATCCTTCAATGGAGGTGTGGTCCTTCAACAAAAATACCCCCCTCTTGAAACTCTGTTTCACCACACCTCCATTGAAGGACCTGAAGCTATGCTTCCTTGTCA 3 0 3' arm Arabidopsis_thaliana pmrd 100 ath-MIR836 3e-66 -67.11 .((((.((((((((((((.((..((((((((((((((((((((.........................(((((...)))))))))))))))))))))))))..)).)))))))))))).)))). (-67.11)