mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTCCAACATGGAGATTCTCACC TGAAGAGCTCATGTTGGAGAAG TGGGTGAAGAGCTCATGTTGGAGAAGTTAAGTACGTGCAAATAAGCAAATGAGACGGATTTCGTGTTTGTTGGTTTGCACGTGCCCTGCTTCTCCAACATGGAGATTCTCACCCG 0 3 3' arm Arabidopsis_thaliana pmrd MIR164 2e-49 ath-MIR164a 1e-59 -63.7 .((((((.(((((((((((((((((((...((((((((((((.(((((((...(((.....)))))))))).))))))))))))...))))))))))))).))).))))))))). (-63.70)