mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTCTCCAACATGGAGATTC GCTCATGTTGGAGAAGTT GGGTGAAGAGCTCATGTTGGAGAAGTTAAGTACGTGCAAATAAGCAAATGAGACGGATTTCGTGTTTGTTGGTTTGCACGTGCCCTGCTTCTCCAACATGGAGATTCTCACCC 0 2 3' arm Arabidopsis_thaliana pmrd MIR164 2e-49 ath-MIR164a 1e-59 -62 ((((((.(((((((((((((((((((...((((((((((((.(((((((...(((.....)))))))))).))))))))))))...))))))))))))).))).))))))))) (-62.00)