mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAGGTGTCGATCGACACCAAC AGGTGTCGAACGACACAACAG GGGCTCGGTGTCGAGCGACACCAACTGGGTGTCGATCGACACCATCGGGAGCAGCACGCAAATGCAATAGGTGTCGAACGACACAACAGAGGTGTCGATCGACACCAACACC 7 0 3' arm Arabidopsis_thaliana pmrd 100 ath-MIR855 0.0003 -58.4 ..((((((((((((.(((((((.....))))))).)))))))).....)))).(((......)))....((((((((.((((((.......)))))).))))))))...... (-58.40)