mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTCGACCTGGGGTTCGAGT TCGGCCTCGGGGTCGAGTGAT AGGTGAAGACACTCGGCCTCGGGGTCGAGTGATGGATCGAGTGATGGTCAGGTGATGGGATGAAGACACTCGACCTCGGGGTCGAGTGATGTGATCGAGTGATGGTCAGGTGATGGGATGAAGACACTCGACCTCGGGGTCGAGTGATGTGATCGAGTGATGGTCAGGTGATGGAGATGAAGACGCTCGACTTCGTGGTCGAGTGTTGAGGTGAAGTTGTGATGTCTTCTACTCGACCTGGGGTTCGAGTGGTCTCTT 4 0 3' arm Arabidopsis_thaliana pmrd 100 100 -120.91 (((.((...((((((..(((.(((((((((.....((((..((((.((((..((((.(.((.....((((((((((((((((((((((((.(.((((..((.....))..)))).).)).....)))))))))))))))))))))))).).))))..)))).))))..))))((((((...(((((((((((....)))))))))))................)))))).))))))))).)))..)))))).)).))) (-120.91)