mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTAGAGTTTTCTGGATACT TATCCAGAAAACTCTAAATTT TTTCAAATTAGAGTTTTCTGGATACTTATTAGTTACTAACAAAGAGAGGGCTTCTTCGATATTAACTTTTAAGTATCCAGAAAACTCTAAATTTGAAA 0 1 5' arm Arabidopsis_thaliana pmrd 100 ath-MIR781 2e-48 -43.9 .(((((((((((((((((((((((((((..(((((.((.(.(((((.....))))).).)).)))))..))))))))))))))))))).)))))))). (-43.90)