mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CACTCGACCTCGGGGTCGAGTGGT TACTCGACCAGGGGGTCGAGTGGTC AGACACTCGACCTCGGGGTCGAGTGGTGAGGTGAAGTGGTGATGTCCTCTACTCGACCAGGGGGTCGAGTGGTCT 3 1 5' arm Arabidopsis_thaliana pmrd MIR854 0.000000000004 100 -43.3 ((((((((((((((..((((((((((.((.((.(.....).)).))..))))))))))..)))))))))).)))) (-43.30)