mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTGTGTGAACTAAACGTGG CTGTTTAGTTCACATCAATC CCTACCATGATGTGATGGAGATGCGATGGAAAGTTGGGAGATTGGGGGAAGTTGTGTGTGAACTAAACGTGGATTGGGGCCCTGTTTAGTTCACATCAATCTTCCTCCAAATTCCCAACTTTTCATCACATCACAATCACATAAACTCT CCTACCATGAACCTACCATGATGTGATGGAGATGCGATGGAAAGTTGGGAGATTGGGGGAAGTTGTGTGTGAACTAAACGTGGATTGGGGCCCTGTTTAGTTCACATCAATCTTCCTCCAAATTCCCAACTTTTCATCACATCACAATCACATAAACTCTAATTTTTTTTCAAAGTACCAACTGTCAAACTTTTTCTCAATTTCAGGATCTAAATGCAGACTGGATTGTGGATTGAAAATTGCGGCTGAAGAACGTGAACATTGAATGCAGACTGCTACATTCGCACTGTTTTGTATCAGTCCGTTAATTCTACAATATTTAGCTGTTTAGTAATTAAACAATGGTCCTGTCATCTTTTGTAACCTGTTAAGATTGATATTGAATAAATCATATTTGCGTATTTT 1 1 5' arm Oryza_sativa mirnest 100 osa-MIR1850 2e-71 -70.8 .........(((((((...((((.((((((((((((((((.(((((((((((((.((((((((((((((.((.......)).))))))))))))))))).)))))))))).)))))))))))))))).))))...)))))))....... (-70.8)