mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGACCTCAAGGTCGAGTGA ACTCGACCTCGGGGTCGAGT CACTCGACCTCAAGGTCGAGTGAAGTGATCGAGTGACCGTGTGGTGATGGAGATGATGGCACTCGACCTCGGGGTCGAGTG 2 0 5' arm Arabidopsis_thaliana pmrd 100 100 -50.4 (((((((((((.((((((((((..((.(((..((.(((....))).))...))).))..)))))))))).))))))))))) (-50.40)