mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAATACGACCCACTAGAAATTGAA CAGTTTCAAGTGGCTCGTATTCACA GAGTTGCATGTGAATACGACCCACTAGAAATTGAAATAAACAAAGAAATTTCATTTTTTGTAGTATAATTTGATAAAATTTTATACTGATATTGTTTCTTTGTTTCTTTCAGTTTCAAGTGGCTCGTATTCACAAGCAACTT 2 0 5' arm Arabidopsis_thaliana pmrd 100 ath-MIR841 7e-77 -63.09 (((((((.(((((((((((.(((((.((((((((((.((((((((((((...........((((((((..(......)..)))))))).....)))))))))))).)))))))))).))))).))))))))))).))))))) (-63.09)