mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGTCTAAACGCAAACGCTGT AGCGTCTGCGTTTTGACCCT TCGCTTTGGGGTCTAAACGCAAACGCTGTTAGCTTTGTGCGGCAATGAAGACTTGGCTTTGGCTATATTTTAACAGCGTCTGCGTTTTGACCCTAACGA 2 0 5' arm Arabidopsis_thaliana pmrd 100 100 -43.4 (((..((((((((.(((((((.(((((((((.(((..(......)..)))...((((....)))).....))))))))).))))))).))))))))))) (-43.40)