mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGGATGACTTGCCGGAACG TTCTGGCAAGTTGTCCTTCG AATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGAACGTTGTTAACCATGCATATGAATAATGTGATGATTAATTATGTGATGAACATATTTCTGGCAAGTTGTCCTTCGGCTACATT 4 0 5' arm Arabidopsis_thaliana pmrd MIR169_2 4e-56 aqc-MIR169c 3e-57 -47 ((((.(((((((((..(((((((((((...((((...(((.(((((((.((((......)))).))))))))))))))...)))))))))))..))))).)))).)))) (-47.00)