mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGACCTGGTGGTCGAGTGG ACTCGGCTTGGGGGTCGAGT GAGGTTACTCGACCTGGTGGTCGAGTGGACGGGAAGAATGGCTCCAAAGTCACTCGACCTGGGGGTCGAGTATGTGGGAAGAATGGCTCCAAAGTCACTCGGCTTGGGGGTCGAGTATGTCTTC 3 0 5' arm Arabidopsis_thaliana pmrd 100 100 -57.9 ((((.((((((((((...((((((((((...(((...((...(((...((.((((((((....))))))))))...)))...))...)))....))))))))))...))))))))))...)))) (-57.90)