mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTTTTCACTGTTTGATTCGT GAATCAAACAGCGAAAAGCGA CAAAATAGTCACTTTTCACTGTTTGATTCGTACACTTAGATTGTACACCACTTTTAGTGTACAAATGTAAAGTGTACTCTGTGTATTTTTATATACATTTGTACACTAAAAGTAGTGTACGGTATAAGTGTACGAATCAAACAGCGAAAAGCGACTATTTTG 2 0 5' arm Arabidopsis_thaliana pmrd 100 ath-MIR5014 0.000000000000002 -94.1 ((((((((((.((((((.((((((((((((((((((((.(((((((((.(((((((((((((((((((((((.((((.....)))).)))...)))))))))))))))))))).))))))))).)))))))))))))))))))).)))))).)))))))))) (-94.10)