mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTTTTCACTGTTTGATTCGT GAATCAAACAGTGAAAAGTAA CAAAATAGTCACTTTTCACTGTTTGATTCGTACACTTAGATTGTACACCACTTTTAGTGTACAAATATATATAAAAATACACAGCGTACACTTTACATTTGTACACTAAAAGTGATGTATAATCCAAGTGTACGAATCAAACAGTGAAAAGTAACTATTTTG 0 0 5' arm Arabidopsis_thaliana pmrd 100 ath-MIR5014 4e-20 -87.72 (((((((((.(((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.((((((((((((((((((.((........(((.....))).....)).)))))))))))))))))).))))))))).))))))))))))))))))))))))))).))))))))) (-87.72)