mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATGATCTTGTCTTCCTCTC GAGAGAGACTAGGTCATGCT AAGCTGCCAGCATGATCTTGTCTTCCTCTCTTAGGTTTCATATATAGTTAATAAATATTTTATATATTTCTTGTTCTTACAAGATTATATGATCATAGCTTAGAGAGAGAGAGAGACTAGGTCATGCTGGTAGTTT 3 0 5' arm Arabidopsis_thaliana pmrd MIR167_1 8e-49 ath-MIR167c 2e-52 -57.9 ((((((((((((((((((.((((..(((((((((((((((((((.........(((((.....)))))((((((....)))))).)))))))....)))))...)))))))..)))).)))))))))))))))))) (-57.90)