mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTCTGCAAACGCCTTGGA CAAGGTGTTTGTAGAAAAAGG TTTTATAACCTCTTTCTGCAAACGCCTTGGATTTTCTTTTGGCTTCATGTTGTTCATTAGAATAATAGCCTTTTCATCTTATTTAAAGAACATCCAAGGTGTTTGTAGAAAAAGGTTTCAAAA 1 0 5' arm Arabidopsis_thaliana pmrd 100 ath-MIR2934 2e-64 -50.56 .(((..(((((.((((((((((((((((((((.((((((.((((....(((((((....)))))))))))..............)))))).)))))))))))))))))))).)))))..))). (-50.56)