mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGTTACTCGACCACGAGGTCGAGTAG ACTCGACCAGGGGGTCGAGTATGTCCTC CCTGAGCTGAGGTTACTCGACCACGAGGTCGAGTAGATGGGAAGAATGGCTCCAAAGTTACTCGACCAGGGGGTCGAGTATGTCCTCTGATTCTGG 5 2 5' arm Arabidopsis_thaliana pmrd 100 100 -45.4 ((.((((.((((.(((((((((....((((((((((...(((........)))....))))))))))....)))))))))...)))).).))).)) (-45.40)