mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAACTTAGAGAAGTTTGACTT GTCGAACTTAGAGAAGTTTGA TAAAGACAATATGAATACATATATTTCATTATGGATAAAATGAAACTAATTTGGTGTCATAAGTCTTGGTATATTTGTCTAAAAGATTGGTCGAACTTAGAGAAGTTTGACTTAAGACAAACATAAATGTTGTACTCCCTC 5 0 5' arm Brachypodium_distachyon pmrd 100 bdi-MIR437 3e-76 -28.6 ..(((((..(((((...((....(((((((........)))))))......))...))))).))))).((((((((((((........((((((((((....))))))))))..))))))).........)))))...... (-28.60)