mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGTCACTTAATTCGGGACGGA CGTCTCAAAATAACTGACGTG CATGTACTCCCTCCGTCTCAAAATAACTGACGTGGATTTGTATAAGTTCTTATACAAATTCACGTCACTTAATTCGGGACGGAGGGTGTATGTG 3 0 3' arm Brachypodium_distachyon pmrd MIR1122 0.000000001 100 -55.6 (((((((.(((((((((((.((.(((.((((((((((((((((((....)))))))))))))))))).))).)).))))))))))).))))))) (-55.60)