mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACCAAGCTTATAGCAAAA TTGTTATATGGTCGGTA AAACTTTACAAAATTTGACCAAGCTTATAGCAAAACATATCAACATATACAATATAAACAAAGATAATATGTTTTGTTATATGGTCGGTAAAGTTT 1 4 5' arm Brachypodium_distachyon pmrd 100 bdi-MIR5169 0.00002 -24.87 (((((((((......((((((....(((((((((((((((..........................)))))))))))))))))))))))))))))) (-24.87)