mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACCAAGTTTATTGAAAAA CTTCTATAAACTTGGTCAAAC TCTTAAAGTTTGACCAAGTTTATTGAAAAATCTACCAACATCGATAACTCTAAATTAGTTTTATTGTATATTCTTCTATAAACTTGGTCAAACTTGGGA 2 0 5' arm Brachypodium_distachyon pmrd 100 bdi-MIR5169 9e-17 -30.41 ((((((.((((((((((((((((.(((.(((.(((.......(((((..(((...)))..)))))))).))).))).)))))))))))))))))))))) (-30.41)