mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGAGTGCAGCGTTGATGAAC TCACCGGCGCTGCACACAGTGA GCAAAGGCATCATTGAGTGCAGCGTTGATGAACAGGGGCCAGGCGACCGGCGGCCGGTCCGGTTCGGTTCACCGGCGCTGCACACAGTGACGCCCTTGC 2 0 5' arm Brachypodium_distachyon pmrd MIR397 0.000000001 bdi-MIR397b 2e-51 -59.3 ((((.(((.((((((.(((((((((((.(((((..(((((..(.((((((...)))))))))))).))))).))))))))))).)))))).))).)))) (-59.30)