mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTCTATACTTCTGTCACC TAGGTTTGAGAGTGATGCTGGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGACATGCAAGTACATATGTATGTATCATCACACCGCCTGTGGATGATTACAAAAATAAAACCAATTCAAAAGAGAGAGAGAGAGAGCCTGCATGTCTACTCTTTCGTGCTCTCTATACTTCTGTCACCACCATTATTTCTTCTTCTTTCTTACCTA 0 2 5' arm Brassica_napus pmrd 100 bna-MIR156b 2e-87 -78 (((((..(((((.((((.((((.((.(((((((((((((((((((.(((((.((((((((.((.(.......(((((((((.(((.....)))))))).)))).............(((......))).......).)).))))))))...))))).))))))))))).)))))))))).)))).)))).......)))))..))))) (-78.00)