mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTGC AGGCAGTCTCCTCGGCTATT AAACGGTGACATGAAGAATGAGAAGTTGTGTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGTCTTAACACCATATCACAGACTTTATCGATAGTCTCTGAGTTGGTTAGGCTGTAGGCAGTCTCCTCGGCTATTCAGACACTCCTCTTTCTCCTCATTTC 1 2 5' arm Brassica_napus pmrd MIR169_5 3e-70 bna-MIR169k 1e-84 -62 ....(....).(((((((.(((.(((.((.((((((((.((((.((((.((((((((((....((((..(((.(((((........))))).)))..)))).)))).)))))))))))))).))))).))).))))).))).))))..))).... (-62.00)