mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGCCAAAGATGACTTGCCG GCAAGTCGACTTTGGCTCTGT TATATGTATCAGAGAGTCATGCATGGGAAAATAGAGAATGATAATGAGCCAAAGATGACTTGCCGATTTTACCAAAGAATTTAAAACTGATAATGGTGACTGGCAAGTCGACTTTGGCTCTGTTTCCTTCTCTTCTTTTCGATGTAAGACTCTAGATATCTAT 2 0 5' arm Brassica_napus pmrd MIR169_2 0.000000003 bna-MIR169m 2e-89 -68.61 .(((.(((((..((((((.(((((.(((((..((((((.((....(((((((((.((((((((((...((((((...................)))))).)))))))))).)))))))))....)).))))))..))))).))))).)))))).))))).))) (-68.61)