mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATTGAGTGCAGCGTTGATGT ATCAACGTTGGCTCAATTATG GAACATCATTGAGTGCAGCGTTGATGTGATTTACTTCTCTTTTTCATTGTTGAATGGATTAAAGCAATTTACATCAACGTTGGCTCAATTATGTTT 1 1 5' arm Brassica_napus pmrd MIR397 5e-46 bna-MIR397a 1e-49 -37.3 ((((((.(((((((.((((((((((((((.((.(((.(((..((((....)))).)))...))).)).))))))))))))))))))))).)))))) (-37.30)