mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGACCATTTGTGAGAAGGGA CCTTCTCATCGATGGTCTAGA CCTCGAGTTGTCTTTCATGTCTAGACCATTTGTGAGAAGGGATTTTTTGTTTGCACCGTTCACCCCACTTTCAATCTGTAGTGAGTATTAAGGAAAATAGCTTGTTCAACATATCACACTACTCTTTTAGAAACAATACTATATTTTAGATGCTTTTCCAGCTTGATATACGTTGTTTTGTTATGTATATCTGTATTATCCCGGCTACCAAAACGTTAAGAAATAAGGTGAACATCCTAAAACCTGCATCCAATTAGAAAGGTCTAGGTCACAGATATTACTTGTTATCTCTTGATTAAGCTATTTTATTTCTATCAGCATGATCAGATCATTCAGGAGTTAAGTATAAACTAAAATACATTAAGTCCATTCATGACATTTCTGGATGCTGCATACATAATATTTTCCTTGTTTTTGGACTATGCCACACTTCGGACAGACATTTTGCCTAAGAGATGTCAAACCTCTGTCTGGAGTGTTAGAGGTATTTCATGATAGCTAAGAACTTGAATCTTGCACTACTTAGCTACACTAGATTACTTCATAGTAAATAACTTGGGGAGTGGGGGAAGGTGCTGGGNTATTATTCCCTTCTCATCGATGGTCTAGATGTGCGAGGTGACTCTCATTGAGG 1 0 5' arm Brassica_oleracea pmrd MIR824 0 bol-MIR824 0 -199.98 ((((((((..((((.(((((((((((((((.(((((((((((..........(((((.(((.(((((((..(....(((((((((((....(((((..(((.................(((......)))........(((.....)))..)))))))).((..(((((((((.........))))))))).......((..(((((.((....(((.((((((((((.(((.............(((((((....((((.(((..((((..(((((........)))))..((((((.(((..(........)..))).)))))))))).....(((.((((((((........)))).)))).)))......))).))))))))))).............))).)))))))))).))).(((((((((((((((((((((((((......)))))))).......))))))))))))....)))))....)).)))))..))...........))..)))))).))))).....(((((....)))))........)..)))))))))))))))...........))))))))))).))))))))))))))).))))..)))).....)))) (-199.98)