mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTCTATACTTCTGTCACCA GTGATGCTGGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGACATGCAAGTACATATGTATGTATCATCACACCGCCTGTGGATGATTACAAAAATAGCCTGCATGTCTACTCTTTCGTGCTCTCTATACTTCTGTCACCACCATTAT 2 1 5' arm Brassica_rapa pmrd 100 bra-MIR157a 5e-81 -67.6 ((((((.((((....(((((((((((((((((((.(((((.((((((((.((...(((...(((((((((.(((.....)))))))).))))...))))).))))))))...))))).))))))))))).)))))))))))).)))))) (-67.60)