mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GATCATGTTCGCAGTTTCACC GGCGCACCGGCATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTATCTTTCTTTCTCTGTTGACGATGGAAAAGACATGAGTGTTGATTAGATCATGTTCGCAGTTTCACCCGTTGACTGTCTCGCC 1 0 5' arm Brassica_rapa pmrd MIR167_1 3e-20 bra-MIR167d 3e-66 -48.1 ((((...(((((.(.(.(((((((((.(((((((((((((((.((((((((.((((((...)))))))))))...)))...))))))))))))))).))))))))).).).)).)))...)))) (-48.10)