mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTAGATTCACGCACAAACTCG AGTTTGTGCGCGAATCTAATC GGACGAGGCATATTTCAAGTTTGTGCGCGAATCTAATCCAAAAAAACTCATCACTGAAACAGGCTTCTTGCCTTCATGGCGGGTGTGTGCTAGATTCACGCACAAACTCGTAATCTGTCTTCGTCT 3 0 3' arm Carica_papaya pmrd MIR403 3e-20 tcc-MIR403a 0.0000000001 -49.9 ((((((((((.(((.(.((((((((((.(((((((...((.....((((..((.(((...((((.....)))))))))..))))...)).))))))).)))))))))).).))).)).)))))))) (-49.90)