mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTCTGCGAGCGGTGCGAGC TCGCACCGCTCGCAGAAGACA CCAGCCCAGCGCTCGCACCGCTCGCAGAAGACATCGCTGGCACCGTGTTGGCCGCCATTTGAGCGCTTGGTCACATCGCTGGCACCCACGGCTGGCACCGTGGCCGCCACTTGACCAAGCGCTAAATATCGGCCAACNCGGTGCCAGCGATGTCTTCTGCGAGCGGTGCGAGCGCTGGGCTGG 0 0 3' arm Chlamydomonas_reinhardtii pmrd 100 cre-MIR907 2e-99 -163.5 (((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((..((((.((((((((((((....(.((((..((((((......))))))..))))).))))))))))))))))..)))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))) (-163.50)