mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCAGCGTCGGGCTCGACCGC CGTTGAGCCCGACGCTGCTGC CCGCTGCAGCCGGTCAGGTGCACCCGGAGGTGCCGGAGCGGTTGGGGTTGCGGGGCCCGCAGGTAGCTGCCGTTGAGCCCGACGCTGCTGCCGCCGCGCCGGTGCTGCTGCGCGGCAGCACCTGACCGGCTGCAGCAGCGTCGGGCTCGACCGCAGCCACCTGCGGGTCCCGCAGCCCCAGCAGCTACCGACTGCACCTGACCGGCTGCACCTGACCGGCTGCAGGG 1 0 3' arm Chlamydomonas_reinhardtii pmrd 100 cre-MIR910 2e-127 -212.2 ((.(((((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((.(((((.((((((((((((((((((((.((((.((.(((((((((....))))))))).).))))).)))))))))))))))))))).))))).)))))))))))))))))))))))).))).)))...))))))..)))).))))))))))))))))))))) (-212.20)