mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCAAGGTCATCGGTTCGATCC ATCGAACCGATGACCTTGGCG ACGGAAACGGTTGTACGGGGCGCCGTACGGTGGTTGTGGGAGAGGGGGGGGCTGGTGGATATGACGTGGGCCTGTTAGCTCAGTTGGTTAGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAGGTCATCGGTTCGATCCCGATACGGGCCAGCGGAAGCCTTTTGGGCCACGCGCCCACGCTGCAATACGCGCACGAGAGGCCTTAAGGATGTAAGGCCTATATGCCTGGTCGGACGGGCGGTCAGACGACATTTGGGGGTTCGGGGGCGCTCGGGGCTATGTATGTTGTGGTGGGAGTCCTGTCATGGTATTGGGGATGGAAAGGCACACAGACGGGAAACATGCAAAGCTGTGGAGGGTATGGATAAGCCGCTGCATGAACCACATAACTGTGGAGGGCAGCCGCTGCAAGTACTGCATTTTGCTTGTGCAGGTAACTGCACTACCAGCCGTGACTACCAGCCCGCAGATAGCCATGTGCAAGCAGTATGCTAGCAGATGCATTGTTCTGTGCTGTTCATTGCCGTGCCAACCACAATCAAAAGGAGTGGCCTTCCCATGCCCTTCTGGCATGCAACTGGCCCACCAAGAACAAGGGAAAACAACAACGGCTGTGATCCACAACGCCACCATACTGCTTTCTGCTAAGAGGCCACCCCACTCCCACCACAACGTACACAACCTCGAGCGGCCCCGACCCTCCAAATAATGTTTGGCCGTCCGTCCTACCAGGCAAATACCTTTTGGGCCTTGCCCGCGCACGTTACAGCGTCAGTCTGTGGCCCAAAAGGCTTCCGCTGGCCCGTATCGGGATCGAACCGATGACCTTGGCGTTATTAGCACCACGCTCTAACCAACTGAGCTAACAGGCCCACATCATATCCCTCAGCCCCCCCCTCTCCCACAACCAGCGTACGGCGCTCCGTACAACCATTTCCGT 0 0 5' arm Chlamydomonas_reinhardtii pmrd tRNA 3e-28 cre-MIR916 0 -639.17 (((((((.(((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((.((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((..((((((.(((..((((.....((((((((......))))))))...((((((((.(((((((((((((((((..(((((((((.((((((.(((((((((...((((((((((((((((((.((......))...(((((.(((...((((........(....)....((((((((((.((((.(((((.(((.(((((.....(((((....)))))...))))).)))(((((........)))))..((((((....))))))...(((((((.........((((((((....(((.(((.(((.....))).))).)))......)))))..(((((......(((.....)))........((.(.((((....((((((.....)))))).....))))).))..))))).))).........)))))))..)))))..)).)).)))))..))))).))))......))))))))))))))))))))))))))...))))))))).)))))).)))))))))..))))))))))))))))).))))))))..........((((...))))))))..))).))))))..)).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))).))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))).))))))) (-639.17)