mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTCACGGTTATGTTCGAAG TCGAACATAACCGTGAAACG GCAGCAACGGCTCCCAGAGCTGACCAATGAGGCCATTGACAACCGCCTGCCGATTCTCTTTGAAGAAGGCGAGCGACTTGTCGCCCGAATACAGCGCCCGAAATTTTGTCACGATCCAGTCACCGGCGTGCGCTTCGATGTGCTGTAACACAGGTCGCGGCGTAGCTACTCTTAAGGCCTCAACCAAAGGGCCTTTGCGGCGTTTCACGGTTATGTTCGAAGTCGGTACTAACAATCTGAACCAAAGTCGGAGCCCAAGTCTGAACCAAAGTCGTTTGGTTCAGACTGTTAGTGCCGACTTTGGTTCAGACTGCTAGTGCCGACTTCGAACATAACCGTGAAACGCCGCAAAGGCCCTTTGGTTGAGGACTTAAGAGTAGCTACGCCGCGACCTGTGTTACAGCACATCGAAGCGCACGCCGGTGACTGGATCGTGACAAAATTTCGGGCGCTGTATTCGGGCGACAAGTCGCTCGCCTTCTTCAAAGAGAATCGGCAGGCGGTTGTCAATGGCCTCATTGGTCAGCTGTGGGAGCCGTTGCTGC 0 0 5' arm Chlamydomonas_reinhardtii pmrd 100 cre-MIR917 0 -550.9 ((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((.((((((((((((((((.((...(((((((((((((....)))))))))))))....)).)))))))))))))))).)).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))) (-550.90)